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Connexionimage biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
4 participants
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image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par Manoo Mer 10 Mar - 11:19
Bonjour à tous !
J'espère que vous vous remettez du stress d'il y a quelques jours !
je vous propose un nouveau document sur le thème de l'immunologie.
Ci dessous une électrophorèse de cellules germinales pour les 2 colonnes de gauche et dans des lymphocytes B immatures pour les 2 colonnes de droite.
Le nom donné aux colonnes correspond au nom d'une région du fragment marqué ("C" pour région constante et "V" pour région variable)
Il s'agit de
1- Décrire le document et expliquer simplement comment on l'a obtenu.
2- Analyser le résultat de l'électrophorèse (Que montre-t-elle?)
3- Comment pouvez vous expliquer cela ?
4- Dans quelles leçons peut-on s'en servir ?
Réponse dès Vendredi matin en spoiler !
Bon courage!
J'espère que vous vous remettez du stress d'il y a quelques jours !
je vous propose un nouveau document sur le thème de l'immunologie.
Ci dessous une électrophorèse de cellules germinales pour les 2 colonnes de gauche et dans des lymphocytes B immatures pour les 2 colonnes de droite.
Le nom donné aux colonnes correspond au nom d'une région du fragment marqué ("C" pour région constante et "V" pour région variable)
Il s'agit de
1- Décrire le document et expliquer simplement comment on l'a obtenu.
2- Analyser le résultat de l'électrophorèse (Que montre-t-elle?)
3- Comment pouvez vous expliquer cela ?
4- Dans quelles leçons peut-on s'en servir ?
Réponse dès Vendredi matin en spoiler !
Bon courage!
Dernière édition par Manoo le Ven 19 Mar - 6:14, édité 1 fois
Manoo- Messages : 2543
Date d'inscription : 16/09/2008 -
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par cocotruc Ven 12 Mar - 10:18
- Spoiler:
Electrophorèse : gel de polyacrylamide entre 2 plaques de verre, le tout alimenté par un courant électrique. Dépôt des solutions (protéines ou acides nucléiques) dans des puits. Migration des molécules chargée selon le courant. Migration +/- loin selon de poids moléculaire : le gel de polyacrylamide formant un réseau, il retient les molécules selon leur taille. Les plus légères vont plus loin. Les molécules sont visibles sous forme de bande
Analyse :
Cellules germinales : les fragments C et V ont des tailles différentes (V plus petit que C)
LB immature : les fragments C et V ont la même taille : ces 2 fragments sont identiques
Les fragments des LB immatures sont différents des 2 fragments des cellules germinales, notamment le fragment V des cellules germinales est plus petit que le fragement V des LB immature
Explication :
J’ai un peu de mal : on parle des LB immature, donc avant maturation dans la moelle osseuse c’est à dire avant sélection des LB qui
ont un BCR qui ne reconnaissent pas molécules du soi mais après l’acquisition de leur BCR « complet »
Je reprends :
Cellule souche - > cellule pro B
Cellule Pro B : Réarrangement des gènes de la chaîne lourde
Synthèse chaîne lourde
Association à une pseudo chaîne légère
Exportation de récepteur à la surface -> cellule pré B
Cellule pré B : Arrêt de l’expression de la pseudo chaîne légère
Disparition du récepteur pré B de la surface
Réarrangement des gènes de la chaîne légère -> Lymphocyte B immature
Lymphocyte B immature : expression d’une BCR « complet »
Sélection négative : Les LB reconnaissant des molécules du soi sont éliminés -> LB mature naïfs
Donc : les LB immatures ont des chaînes lourdes et légères réarrangées
Oh pis j’y comprend plus rien puisque qu’on nous parle des parties C et V et non pas légère et lourde !
cocotruc- Messages : 1031
Date d'inscription : 16/09/2008
Age : 51
Localisation : Marne
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par Manoo Ven 12 Mar - 11:49
pas de panique Corinne !
C c'est pour les régions constantes (entre chaque chaine) et V régions variables (soient différentes d'une chaine à l'autre)
je n'attends pas d'explication concernant les chaines variables et hypervariable, juste l'explication du document)
ah et puis je me suis peut-être mal exprimée
A TOUS!!!!!
quand on note "C" c'est pour dire que la sonde est complémentaire de la séquence codant pour la région constante sur l'ADN
quand c'est noté "V" c'est la même chose pour la région variable.
C c'est pour les régions constantes (entre chaque chaine) et V régions variables (soient différentes d'une chaine à l'autre)
je n'attends pas d'explication concernant les chaines variables et hypervariable, juste l'explication du document)
ah et puis je me suis peut-être mal exprimée
A TOUS!!!!!
quand on note "C" c'est pour dire que la sonde est complémentaire de la séquence codant pour la région constante sur l'ADN
quand c'est noté "V" c'est la même chose pour la région variable.
Manoo- Messages : 2543
Date d'inscription : 16/09/2008 -
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par cocotruc Ven 12 Mar - 12:12
Manoo a écrit:pas de panique Corinne !
C c'est pour les régions constantes (entre chaque chaine) et V régions variables (soient différentes d'une chaine à l'autre)
je n'attends pas d'explication concernant les chaines variables et hypervariable, juste l'explication du document)
ah et puis je me suis peut-être mal exprimée
A TOUS!!!!!
quand on note "C" c'est pour dire que la sonde est complémentaire de la séquence codant pour la région constante sur l'ADN
quand c'est noté "V" c'est la même chose pour la région variable.
Ca, je l'avais bien compris...
cocotruc- Messages : 1031
Date d'inscription : 16/09/2008
Age : 51
Localisation : Marne
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par peripatus Ven 12 Mar - 17:00
- Spoiler:
- Il y a trop peu d'éléments d'information sur cette électrophorèse : qu'est ce qu'on fait migrer ?
de l'ADNc ou une fragmentation d'ADN nucléaire ? Quelle est l'orientation de la migration (même si on s'en doute un peu) ?
l'hybridation se fait sur les fragments de chaîne lourde ou chaîne légère (on peut penser que c'est la chaîne lourde) ? est-tu sûre qu'il s'agit d'un LB "immature" ?
Parce que je ne voit qu'une façon d'interpréter les résultats:- le raccourcissement du fragment de la région C est dû à une commutation isotypique faisant passer la région C d'un gène codant pour une protéine transmembranaire à un gène codant pour une protéine "libre"
- l'allongement du fragment de la région V est dû au réarrangement génétique VDJ où des gènes J et D viennent se concaténer à un gène V. On passe alors d'un segment simple V à un segment VDJ plus long.
Mais, pour moi, la commutation isotypique ne se déroule que dans un lymphocyte B "mature" (autrement dit activé par un antigène). D'où mon interrogation. Mais peut-être que je me trompe ? - le raccourcissement du fragment de la région C est dû à une commutation isotypique faisant passer la région C d'un gène codant pour une protéine transmembranaire à un gène codant pour une protéine "libre"
peripatus- Messages : 293
Date d'inscription : 18/09/2008
Age : 50
Localisation : Rhône -
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par Manoo Ven 12 Mar - 20:03
Bon je reprends mes propres consignes (c'est pas clair du tout 
)
Ci dessous une électrophorèse sur l'ADN de cellules germinales pour les 2 colonnes de gauche et sur l'ADN des cellules lymphoïdes de la lignée B pour les 2 colonnes de droite. (ce à quoi je veux vous emmener ne nécessite pas plus d'information mais oui vous avez raison ce sont des LB matures)
Le nom donné aux colonnes correspond au nom d'une région du fragment marqué ("C" pour région constante et "V" pour région variable de la chaîne lourde des Ig mais ce n'est pas ce que je recherche ici j'ai fait exprès de ne pas le dire)
On a à faire à des fragments d'ADN, comme indiquer sur le document, que l'on a obtenu par action d'enzyme de restriction
Il s'agit de
1- Décrire le document et expliquer simplement comment on l'a obtenu.
2- Analyser le résultat de l'électrophorèse (Que montre-t-elle?) le sens de migration importe peu me semble-t-il... comparez le taux de migration 2 à 2 notamment comparer les 2 migrations dans la cellule B
3- Comment pouvez vous expliquer cela ?
4- Dans quelles leçons peut-on s'en servir ?
[j'espère que c'est plus clair
je m'excuse]
[/quote]
)Ci dessous une électrophorèse sur l'ADN de cellules germinales pour les 2 colonnes de gauche et sur l'ADN des cellules lymphoïdes de la lignée B pour les 2 colonnes de droite. (ce à quoi je veux vous emmener ne nécessite pas plus d'information mais oui vous avez raison ce sont des LB matures)
Le nom donné aux colonnes correspond au nom d'une région du fragment marqué ("C" pour région constante et "V" pour région variable de la chaîne lourde des Ig mais ce n'est pas ce que je recherche ici j'ai fait exprès de ne pas le dire)
On a à faire à des fragments d'ADN, comme indiquer sur le document, que l'on a obtenu par action d'enzyme de restriction
Il s'agit de
1- Décrire le document et expliquer simplement comment on l'a obtenu.
2- Analyser le résultat de l'électrophorèse (Que montre-t-elle?) le sens de migration importe peu me semble-t-il... comparez le taux de migration 2 à 2 notamment comparer les 2 migrations dans la cellule B
3- Comment pouvez vous expliquer cela ?
4- Dans quelles leçons peut-on s'en servir ?
[j'espère que c'est plus clair
je m'excuse][/quote]
Manoo- Messages : 2543
Date d'inscription : 16/09/2008 -
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par Julie Dim 14 Mar - 20:30
Donc ce sont biens des LB matures: bon, je reprends la réflexion (au point mort, vexée d'avoir rien compris...)
Julie- Messages : 989
Date d'inscription : 23/09/2008
Age : 46
Localisation : montpellier
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par peripatus Lun 15 Mar - 18:12
Manoooooo !!!! Arrête le suspense !! c'est quoi la réponse ? 
peripatus- Messages : 293
Date d'inscription : 18/09/2008
Age : 50
Localisation : Rhône -
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par Manoo Mar 16 Mar - 6:19
bah c'est pas drôle!
Vous êtes sur la bonne voix en plus !
Bon ce soir alors!
Vous êtes sur la bonne voix en plus !
Bon ce soir alors!
Manoo- Messages : 2543
Date d'inscription : 16/09/2008 -
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par Manoo Ven 19 Mar - 9:09
"Correction"
1- C'est une électrophorèse obtenue à partir de fragmentation d'ADN de cellules germinales et de cellules de la lignée B. On récupère l'ADN fragmenté que l'on fait migrer sur un gel polyacrylamide en faisant traverser un courant électrique. La migration des fragments se fait selon la masse et la charge électrique.
Les bandes observées sont visibles grâce à un marquage de séquences voulues par une sonde radioactive complémentaire de ces séquences de l'ADN (ici V et C).
2- Dans une cellule germinale, selon que le marquage se fait sur la région C ou V la distance de migration est différente. L'un des fragments est plus lourd que l'autre. On a donc 2 fragments : l'un marqué par la sonde "ADNCc" et l'autre marqué par la sonde "ADNVc"
Dans une cellule de la lignée B, la migration se fait sur la même distance dans les 2 cas de marquage. On peut donc supposé que dans la lignée B, les 2 séquences appartiennent au même fragment (qui n'a pas été scindé par les enzymes de restrictions qui n'ont donc pas de séquence d'action sur le fragment marqué)
On a donc probablement un seul fragment avec les 2 séquences C et V se trouvant sur le même fragment. (ou éventuellement 2 fragments de même taille)
3- En effet, lors de la maturation et l'activation des lymphocytes, leur ADN subit de profonds remaniements, dont la délétion d'une grand partie de l'ADN, ce qui rapproche les séquences nécessaires à la transcription de l'ARN permettant la synthèse des anticorps. On a donc une perte d'ADN.
Ce qui explique le résultat de l'électrophorèse.
Cette délétion a provoqué la perte de la séquence de restriction de l'enzyme ce qui rassemblé les 2 fragments (visibles dans les cellules germinales) en un seul.
Le fait que dans un cas l'ADN marqué paraisse plus lourd ou plus léger dans l'autre résulte du fait que la combinaison des 2 fragments + la délétion d'une partie de l'ADN donne un fragment de masse intermédiaire.
On appelle cela une mutation (délétion) somatique.
Ce phénomène fait partie intégrante du processus de différenciation, maturation et activation des lymphocytes.
Ces cellules sont l'exception à la règle selon laquelle toutes les cellules de l'organisme possèdent la même information génétique!
4- on peut utiliser ce type de document lors d'une leçon sur les défenses immunes spécifiques où l'on doit expliquer la spécificité des anticorps.
Voilà!
Questions? critiques?
1- C'est une électrophorèse obtenue à partir de fragmentation d'ADN de cellules germinales et de cellules de la lignée B. On récupère l'ADN fragmenté que l'on fait migrer sur un gel polyacrylamide en faisant traverser un courant électrique. La migration des fragments se fait selon la masse et la charge électrique.
Les bandes observées sont visibles grâce à un marquage de séquences voulues par une sonde radioactive complémentaire de ces séquences de l'ADN (ici V et C).
2- Dans une cellule germinale, selon que le marquage se fait sur la région C ou V la distance de migration est différente. L'un des fragments est plus lourd que l'autre. On a donc 2 fragments : l'un marqué par la sonde "ADNCc" et l'autre marqué par la sonde "ADNVc"
Dans une cellule de la lignée B, la migration se fait sur la même distance dans les 2 cas de marquage. On peut donc supposé que dans la lignée B, les 2 séquences appartiennent au même fragment (qui n'a pas été scindé par les enzymes de restrictions qui n'ont donc pas de séquence d'action sur le fragment marqué)
On a donc probablement un seul fragment avec les 2 séquences C et V se trouvant sur le même fragment. (ou éventuellement 2 fragments de même taille)
3- En effet, lors de la maturation et l'activation des lymphocytes, leur ADN subit de profonds remaniements, dont la délétion d'une grand partie de l'ADN, ce qui rapproche les séquences nécessaires à la transcription de l'ARN permettant la synthèse des anticorps. On a donc une perte d'ADN.
Ce qui explique le résultat de l'électrophorèse.
Cette délétion a provoqué la perte de la séquence de restriction de l'enzyme ce qui rassemblé les 2 fragments (visibles dans les cellules germinales) en un seul.
Le fait que dans un cas l'ADN marqué paraisse plus lourd ou plus léger dans l'autre résulte du fait que la combinaison des 2 fragments + la délétion d'une partie de l'ADN donne un fragment de masse intermédiaire.
On appelle cela une mutation (délétion) somatique.
Ce phénomène fait partie intégrante du processus de différenciation, maturation et activation des lymphocytes.
Ces cellules sont l'exception à la règle selon laquelle toutes les cellules de l'organisme possèdent la même information génétique!
4- on peut utiliser ce type de document lors d'une leçon sur les défenses immunes spécifiques où l'on doit expliquer la spécificité des anticorps.
Voilà!
Questions? critiques?
Dernière édition par Manoo le Ven 19 Mar - 14:06, édité 1 fois
Manoo- Messages : 2543
Date d'inscription : 16/09/2008 -
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par cocotruc Ven 19 Mar - 9:43
"C'est une électrophorèse obtenue à partir de fragmentation d'ADN de lymphocytes B" de 2 type de cellules : cellule germinale et cellule de la lignée lymphoïde B
J'avais effectivement pas tout bien compris! je reprendrais ça plus tard! Merci!
J'avais effectivement pas tout bien compris! je reprendrais ça plus tard! Merci!
cocotruc- Messages : 1031
Date d'inscription : 16/09/2008
Age : 51
Localisation : Marne
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
par Manoo Ven 19 Mar - 14:01
ahhhhhhhhhhhhhh oui merci Corinne 
désolée je corrige ça
désolée je corrige ça
Manoo- Messages : 2543
Date d'inscription : 16/09/2008 -
Re: image biologie 7 - électrophorèse et réarrangement de l'ADN de cellules immunitaires
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