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Couplages énergétiques

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Message par Toumai Dim 28 Juin - 11:30

Bonjour,

je suis en train de bosser sur cette leçon qui est vraiment pas évidente pour moi.
Qu'entend t-on exactement par couplage énergétique? Pour moi c'est le transfert d'une énergie "mécanique" comme le gradient de protons au travers de la membrane en une énergie "chimique" qui est l'ATP par ex.
Mais on dit d'une réaction qu'elle est couplée lorsque elle nécessite un ATP ou FADH ou NADH pour pouvoir se réaliser car elle est endergonique.
J'ai cherché mais j'ai pas vu de post la dessus

Je propose un petit plan pourri que je ne me permet même pas de mettre dans la partie plan

PB : comment la cellule peut elle obtenir de l'energie utilisable grâce aux couplages énergétiques?

I) Couplage energétique dans les chaines d'oxydo-réduction
a) Chaines respiratoires
b) Chaines photosynthétiques

II) Formation d'ATP grâce à la chimioosmose
a) La pompe à protons et l'ATP synthéthase
b) Les couplages énergétiques liés à l'ATP

C'est vraiment nul mais j'arrive pas à mieux

Merci!!
Toumai
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Message par Manoo Dim 28 Juin - 11:44

euh pour moi le couplage c'était le fait que 2 réactions se complétaient par exemple
n'ont lieu que si l'une et l'autre ont lieu

par exemple le cycle de Krebs est couplé à la glycolyse par les substrat l'ATP etc...

désolée c'est pas trop ma tasse de thé j'ai un peu du mal à trouver les mots justes

du coup ton plan me paraît catalogue
et le titre du II ne colle pas avec le sujet (le titre pas le contenu!)

voilà tout ce que je peux dire
Manoo
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Message par Toumai Dim 28 Juin - 11:46

Je sais t'as raison en fait c'est plus un brain strorming qu'un plan parce que sur cette leçon je suis perdu, c'est exactement le genre de leçon que je redoute.

Dans le campbell il parle de couplage pour la chimio-osmose et pour l'intervention d'ATP dans les réactions endergoniques.

Merci
Toumai
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Message par Manoo Dim 28 Juin - 11:58

ben me semble que l'ATP est au coeur du couplage des réactions...

je ne pourrai en dire plus désolée Sad
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Message par Toumai Dim 28 Juin - 12:00

Pas de souci je vais attendre les avis des autres et pendant ce temps je réfléchis à comment faire un plan correct.

Ah oui et pour les manip??? Ya quelque chose à faire à votre avis?
Toumai
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Message par Cattina Dim 28 Juin - 14:00

Pour les manip', je vois pas...

Pour les couplages, ok avec Manoo, c'est le fait que 2 réactions ont lieu en parallèle.
En général, ça a rapport avec l'ATP mais pas obligatoirement, il me semble (je cherche un ex...)

Essaie de lister les types de couplage et de voir à quoi ils servent. Si il y a des points communs et des différences. Ce qu'ils amènent au vivant...

Pas évident, en effet...

PS Déplacé quand même dans "plans" c'est plus simple...
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Message par Manoo Dim 28 Juin - 14:17

autre exemple
le pouvoir réducteur pour être une plaque tournante aussi dans le métabolisme
pas toujours avec l'intervention d'ATP si ?
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Message par Cattina Dim 28 Juin - 14:28

Ben oui, voilà, les molécules comme NADP, NADPH ... peuvent être au coeur de couplages.
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Message par Toumai Dim 28 Juin - 14:48

Oui oui c'est ce que j'avais mis plus haut, en fait un couplage c'est le fait de pouvoir réaliser une réaction endergonique grâce à une co-enzyme d'oxydo-réduction (FAD, NAD, ATP...) : on couple une réaction endergonique avec une exergonique afin d'obtenir un deltaG négatif. Mais il ya aussi la chimio-osmose qui couple la force proto-motrice à la synthèse d'ATP.

Donc bilan : aucune idée pour le plan!!
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Message par gide1605 Dim 28 Juin - 15:48

les cellules pour maintenir leur homéostasie dans le temps face aux fluctuations du milieux doivent mettre en réserve une source d'énergie. Elles utilisent ensuite ce stock pour leurs fonctions. Ceci nécessite l'existence d'une forme d'énergie mobile: ATP et Pouvoir reducteur qui sont la monnaie d'échange de la cellule.
rappeler principe de la thermodynamique: quantité constante d'énergie dans l'univers.
la cellule va donc transformer énergie suivant divers couplages.

à organiser je ne sais comment:

couplage chimio-chimique: activation d'une enzyme par hydrolyse d'atp
couplage chimio-mécanique: hydrolyse ATP mouvement myosine/actine
couplage osmo-chimique: ATP synthase
couplage chimio-osmotique: pompe H+/ pompe Ca++
couplage PR-osmotique: chaine d'oxydoréduction mithochondriale et chloroplaste
couplage osmo-osmotique: transport II

?

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Message par Toumai Dim 28 Juin - 16:10

Oulala j'avais pas pensé à tout ça

Mais alors quelle est la différence entre couplage chimio-osmotique et osmo-chimique???
Et que signifie PR-osmotique?

Merci pour ces exemples, je vais essayer d'organiser ça...
Toumai
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Message par gide1605 Dim 28 Juin - 16:15

de chimique a osmotique : l'hydrolyse de l'ATP genre un flux d'ions dans les pompes ATPase ( peut etre qu'on peut voir le coté mécanique ! l'énergie apporté par l'atp modifie la conformation de la pompe . donc précaution.

d'osmotique a chimique: c'est le flux d'ions qui génère de l'énergie chimique: cas de l'ATP synthétase.

PR= pouvoir réducteur je sais pas trop comment designer l'énergie d'une chaine d'oxydoréduction. mais dans le cas des chaines redox mitochondriale et chloroplaste: la chaine redox permet de générer un gradient de H+: flux osmotique.

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Message par gide1605 Dim 28 Juin - 16:18

il y a aussi le couplage "photo-électrique" au début de la phase claire de photosynthèse

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Message par Toumai Dim 28 Juin - 16:19

Et les couplages utilisant NAD et FAD tu les mettrais ou? Dans le couplage PR-Osmotique?

Une idée pour un schéma bilan??!!! Pour les manip peut être montrer la mise en évidence de la formation d'ATP dans les cloroplastes (je sais plus le nom de l'expérience) mais ça reste sur papier, je pense pas qu'il y ait des manip réalisables sur cette leçon...
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Message par gide1605 Dim 28 Juin - 16:25

euh, oui c'est un peu bizarre,
dans ce que j'ai dis avant voir plutot: couplage electro-osmotique.
pour les coenzymes réduit: je vois surtout leur influence chimique

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Message par Toumai Dim 28 Juin - 16:35

Bon on essaye d'organiser tout ça???
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Message par gide1605 Dim 28 Juin - 16:41

euh, j'y avais réfléchis un peu l'autre jour,
j'ai d'abord pensé a organiser suivant anabolisme et catabolisme.
ça peut être sympa et permet de faire une troisième partie schématique en présentant les voies métaboliques principales les points de production d'atp, et de coenzyme réduit, et leurs utilisations.

la je suis dans les programmes, j'ai un EDS d'entrainement demain et je suis largué la dessus . donc je reviendrais plus tard sur les couplages .

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Message par Toumai Dim 28 Juin - 18:13

Bon je balance un petit plan vite fait mais je ne pense pas que j'arrive à être complet sur une leçon comme celle la

Intro : explication du couplage énergétique, rappels de thermodynamiques (deltaG...)

PB : en quoi les couplages énergétiques permettent ils le fonctionnement d'une cellule?

I) Couplages liés au catabolisme
a) Glycolyse
b) Cycle de Krebs
c) Chaines respiratoires et chimiosmose

II) Couplages liés à l'anabolisme
a) Chimiosmose des chaines photosynthéiques
b) Couplages du cycle de Calvin
c) Couplages lors de la synthèse de protéines

III) Autres types de couplages
a) Couplages mécaniques (cellule musculaire)
b) Couplages d'activation (enzymes, ATPase, récepteurs membranaires, cascades de phosphorylations, récepteurs couplés à une protG...)

Voila, je suis pas du tout persuadé de ce que j'ai fais et j'ai l'impression de passer à coté et de faire un catalogue des couplages et aussi d'en oublier.

Au fait j'ai fait sans livre, une idée de la biblio pour ce sujet?

Merci
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Message par gide1605 Dim 28 Juin - 19:30

euh, je ne mettrais pas "autres couplages" dans le III,
tous les couplages cités interviennent des les voies du I et II.
le couplage mécanique du muscle est tout seul, je le citerais en conclusion.

pour le I: peut être ne pas se limiter au glucose: acides gras. corps cétonique ?
le détails des voies on s'en fou donc on peut voir large,
représenter seulement les étapes irréversibles de chaque voies car nécessitant apport d'énergie. ("chimio/chimique")

on progresse alors a krebs puis a chaine respi. on aura vu a ce stade pas mal de couplages.

j'intégrerais la phase photo-chimique de la photosynthèse dans cette partie: partie que je nommerais d'ailleurs énergétique cellulaire.


ccl bancale: la mise a disposition d'énergie libre pour la cellule consomme elle même un partie de l'énergie produite.
mais le jeu des réactions (découplage au sens large) permet de fournir plus d'énergie ou du moins de la "concentrer" sous une forme exploitable facilement et partout.

II) utilisation de l'énergie pour le fonctionnement cellulaire


CCL toutes transformations de matières, mouvements, flux ioniques indispensable a la cellule se font par transfert d'énergie. les échangeurs clés sont l'atp et les coenzymes réduits qui agissent partout.
point commun entre photosynthèse et chaine respiratoire dans l'utilisation des chaines red-ox.

(conclusion perso: plus j'y réfléchis et plus ca me dépasse !)

pour la biblio: j'ai "biochimie structurale et métabolique" de christian moussard.

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Message par Toumai Dim 28 Juin - 22:54

"(conclusion perso: plus j'y réfléchis et plus ca me dépasse !)"

Idem pour moi, merci pour ce plan il est pas mal je pense en tout cas mieux que le mien!!
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Message par gide1605 Dim 28 Juin - 23:14

je reviens sur la question des manip.
simplement pour dire que je n'en vois pas non plus !.

mais bon le jour J en étant en forme et avec une bonne biblio peut être que l'on peut tomber sur quelque chose de sympa.
concernant l'atp je me demandais comment le mettre en évidence, je suis tombé sur des trucs de bioluminescence je ne comprend pas trop mais bon, peut être existe-il des images de mise en évidence de l'atp.

mais strictement le sujet ne nécessite pas de manipulation ni même de réelle observation.
il vaut mieux prendre le temps de faire de beaux schémas, et un schéma bilan complet et clair (chose qui doit prendre pas mal de temps !)

et P***** ça approche !

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